Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q8C708 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q8C708 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q8C708 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8C708 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms