Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Atg16l1Q8C0J2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg16l1Q8C0J2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Atg16l1Q8C0J2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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