Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc2Q8BZW8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms