Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms