Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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