Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap2lQ7TS74 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms