Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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