Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme8Q715T0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms