Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp8b3Q6UQ17 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms