Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrp12Q6P5B0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrp12Q6P5B0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms