Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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