Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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