Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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