Protein–RNA interactions for Protein: Q64729

Tgfbr1, TGF-beta receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr1Q64729 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr1Q64729 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr1Q64729 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr1Q64729 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr1Q64729 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr1Q64729 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms