Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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