Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ss18Q62280 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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