Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp1Q62209 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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