Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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