Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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BcanQ61361 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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BcanQ61361 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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BcanQ61361 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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BcanQ61361 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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BcanQ61361 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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BcanQ61361 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms