Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms