Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atf3Q60765 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms