Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms