Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps54Q5SPW0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps54Q5SPW0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms