Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf12Q5SPL2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms