Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms