Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms