Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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