Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms