Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2b3Q0VF55 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms