Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms