Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms