Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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