Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F13bQ07968 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms