Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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