Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms