Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms