Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox10Q04888 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms