Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms