Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1sQ02789 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms