Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb4Q02738 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms