Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RykQ01887 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RykQ01887 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RykQ01887 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RykQ01887 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms