Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top2aQ01320 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top2aQ01320 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms