Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoa1Q00623 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms