Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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