Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms