Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nbr1P97432 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nbr1P97432 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms