Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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