Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf5P70191 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms