Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SbdsP70122 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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