Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rps11P62281 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms